Sistem Pendidikan di STT SAPPI dirancang untuk mempersiapkan para hamba Tuhan dan calon guru agama Kristen yang berjiwa kepemimpinan pelayan, berkarakter kristiani dan memiliki kreativitas yang tinggi, serta berorientasi pada masyarakat pedesaan di Indonesia. 

Dengan dasar tersebut, maka kurikulum di STT SAPPI disusun secara holistik berdasarkan rancang bangun dalam konteks masyarakat pedesaan yang berkaitan dengan pendekatan sosial masyarakat agraris seperti:

Pertanian, Sosiologi, Ilmu Gizi dan Kewirausahaan.